第一步：在南京海关门户网站办事指南-企业管理链接下载《报关单位情况登记表》《企业管理人员情况登记表》《出资者情况登记表》，填写企业基本信息并加盖企业公章及法人印鉴章。

第二步：到企业所在地主管海关业务现场的金关中心或在授权报关行的“中国电子口岸报关行专用版”预录入上述三张表格所有信息并获取编预录入编码。

第三步：持已录入的表格及相关证件材料向主管海关企业备案窗口办理报关单位海关注册登记审核手续；根据《中华人民共和国海关对报关单位注册登记管理规定》（海关总署令第127号）的规定，其中相关证件材料包括：

（一）企业法人营业执照副本原件及复印件（个人独资、合伙企业或者个体工商户提交营业执照副本）；

（二）对外贸易经营者登记备案表原件及复印件（法律、行政法规或者商务部规定不需要备案登记的除外）；

（三）中华人民共和国外商投资企业批准证书原件及复印件（外商投资企业提交）；

（四）企业章程原件及复印件（非企业法人免提交）；

（五）税务登记证书副本原件及复印件；

（六）以人民币为基本帐户的银行开户证明原件及复印件；

（七）组织机构代码证书副本原件及复印件；

（八）《报关单位情况登记表》《企业管理人员情况登记表》《出资者情况登记表》并加盖单位公章及法人印鉴章（点击南京海关门户网站办事指南-企业管理链接可下载）

（九）办理报关单位海关注册登记手续的人员须携带本人身份证件原件及单位出具的加盖公章的介绍信。

第四步：经海关审核并登记备案后，企业获取《中华人民共和国海关进出口货物收发货人报关注册登记证书》及报关专用章刻制式样，具名签收，并在启用前向海关备案印模。

第五步：江苏省内企业在主管海关办理备案登记手续后需前往中国电子口岸南京数据分中心办理电子口岸入网手续包括IC卡制卡手续。